Bij radiofrequente ablatie (RFA) wordt het meest oppervlakkige laagje van de slokdarm (het slijmvlies) kortdurend sterk verhit, waardoor dit laagje afsterft.

Bij een RFA ballonbehandeling wordt een (onopgeblazen) ballonnetje in de slokdarm gebracht en voorzichtig opgeblazen. Om de behandelballon heen is een dunne metalen draad gewikkeld die warmte afgeeft. De RFA ballon wordt opgeblazen en ongeveer 1 seconde verhit. Afhankelijk van de lengte van de Barrett slokdarm wordt de ballon verplaatst en nog een keer verhit. Bij RFA ontstaat zo een soort oppervlakkige brandwond in de slokdarm. Hierna zal de slokdarm genezen en groeit het oorspronkelijke slijmvlies terug.

RFA wordt endoscopisch uitgevoerd: dit wil zeggen met behulp van een endoscoop, een lange dunne flexibele slang.

RFA wordt toegepast bij patiënten met onrustige cellen (dysplasie) of een vroege vorm van kanker in een Barrett slokdarm. Voor het beste behandeleffect zijn meestal drie RFA behandelingen nodig, met tussenpozen van twee tot drie maanden.